排尿时出现尿疼，尿不尽，可能与泌尿系感染有关，泌尿系感染主要表现为排尿次数增多，在排尿时出现尿道内疼痛等，严重者甚至还会伴有发热、腰痛等全身症状。另外也可能与泌尿系统结石有关，特别是膀胱结石和输尿管结石患者在发病期间排尿时均可出现不同程度的疼痛感，尿完后也感觉到有些尿不尽。
尿痛伴尿不净感可能是尿路感染（UTI）的症状，尤其是膀胱炎或尿道炎。尿路感染是由细菌侵入尿道、膀胱甚至肾脏所引起的，常见症状包括尿频、尿急、尿痛以及排尿后仍有尿意。其他可能的原因包括前列腺炎（男性）或盆腔炎症（女性），这些情况也可能导致类似的症状。
结石或肿瘤阻塞尿路时，也会引起尿痛和排尿困难。此外，神经系统疾病或膀胱肌肉功能异常也可能导致排尿不完全或尿痛。