怀孕以后巧克力囊肿消失还会出现复发。在临床当中，巧克力囊肿是子宫内膜异位症，属于素依赖性疾病，由于女性在怀孕以后卵巢的分泌功能受到干扰，所以对于巧克力囊肿会有一定的缓解作用，如果此时女性的巧克力囊肿体积比较小，就会出现消失，但是如果在分娩之后月经恢复正常，巧克力囊肿就会再次复发。
巧克力囊肿患者是否可以怀孕，需要根据具体病情来判断。如果巧克力囊肿体积较小，没有破裂且未影响卵巢功能，通常能够正常怀孕。然而，如果囊肿体积较大，出现破裂或导致卵巢功能受损，可能会影响受孕能力，甚至导致不孕。此外，巧克力囊肿还可能引起盆腔粘连、卵巢功能障碍等问题，进一步增加受孕难度。
因此，对于巧克力囊肿患者，建议及时就医，根据病情采取合适的治疗措施。在治疗过程中，医生会根据患者的年龄、生育要求、症状严重程度等因素进行综合评估。如果计划怀孕，应在医生指导下进行充分准备和监测，以提高受孕成功率。