念珠菌性阴炎一般是可以自愈的，但是也需要根据患者病情的严重程度进行综合考虑，如果症状轻微的不治疗，可能也会自行恢复。但是如果患者症状比较严重，得不到及时有效的治疗可能会导致病情加重，并不会自愈。当患有该疾病时，可以在医生的指导下，使用特比萘芬阴道泡腾片等药物治疗。
念珠菌性阴道炎也称为霉菌性阴道炎，医学上也叫外阴阴道假丝酵母菌病，常用药物包括使用抗真菌药物、外用药物、中药等。
常用的药物有克霉唑、咪康唑、氟康唑等，可以制成阴道栓剂或阴道霜剂。这些药物直接作用于阴道，减少副作用，是首选的治疗方法。外用药物包括克霉唑阴道栓、达克宁栓、制霉素栓等，这些药物可以直接作用于阴道内部，对念珠菌产生抑制作用。
红核妇洁洗液等可用于清洗外阴，帮助保持外阴的清洁。针对反复发作或特定类型的念珠菌性阴炎，中医药物如六味地黄汤加减、五味消毒饮、加减完带汤等也可考虑使用。
要注意的是，上述药物应在医生的指导下规范使用。保持良好的个人卫生习惯，避免过度清洗和使用香皂，穿透气性好的棉质内裤，避免使用含有糖分的避孕套或润滑剂，以及维持健康的生活方式，都有助于预防念珠菌性阴道炎的复发。