扁桃体肿大切除后通常是不会复发的，扁桃体切除手术通常是将扁桃体全部切除，是不会出现再复发的情况，在治疗期间，患者要多喝水，避免食用辛辣、刺激、上火类的食物，可以增加适当的体育锻炼，能够提高自身的抵抗力。
如果扁桃体反复发炎，每年发作次数超过一定限度如3-4次，并且症状严重，如高烧、咽喉剧痛、吞咽困难等，或者扁桃体肥大可能导致呼吸道阻塞，引起打鼾、睡眠呼吸暂停等症状，或者如果扁桃体肥大或炎症引起了其他并发症，如扁桃体周围脓肿、心肌炎、肾炎等，会建议切除扁桃体。
扁桃体能切除，但是会有一定影响。扁桃体切除后，会发生免疫力下降、感冒等后遗症。喉咙、气管、食管等处缺乏免疫防护，容易患感冒、上呼吸道感染、肺部感染。由于扁桃腺是消化道与呼吸道的交界处，是人体最重要的淋巴组织。还很容易导致肺部感染。