痰里有真菌是否严重需要根据感染的程度进行分析。
1、不严重
痰里有真菌如果是芽生菌、球孢子菌、副球孢子菌等致病菌，患者表现出咳嗽、咳痰、发热等症状，通常是不严重的。
2、严重
如果感染的是曲霉菌、隐球菌、毛霉菌等真菌，患者通常咳痰量比较大，痰液比较黏稠，同时伴有臭味，有的患者痰液中会带有血丝，在听诊时肺部可能会有湿啰音，严重的可能会出现憋喘，甚至引起肺栓塞，危及到患者的生命，所以是比较严重的。
痰里有真菌可以遵医嘱使用氟康唑片、伊曲康唑胶囊、伏立康唑片等药物进行治疗。
