口服益生菌一般情况下不可以调节妇科菌群。具体分析如下：
口服益生菌具有平衡肠道内菌群，调节肠道功能的作用，进入胃肠道之后能够增加肠道内的有益菌，减少有害菌，用于改善肠道菌群失调所引起的消化不良、腹痛、腹泻等胃肠功能紊乱引起的不适症状。口服益生菌只针对肠道产生作用，并不能达到阴道内部，所以不具备调节阴道菌群的功效，因此不可以调节妇科菌群。
对于妇科阴道菌群失调的女性，建议到医院完善相关检查之后，遵医嘱在阴道局部使用调节阴道酸碱度和菌群的益生菌，有助于改善症状。
