月经不调总是排不干净可能是宫颈柱状上皮异位、子宫内膜炎、子宫内膜异位症等原因引起。具体分析如下：
1、宫颈柱状上皮异位
宫颈柱状上皮异位可能导致子宫内膜脱落不全，宫颈柱状上皮异位可能导致子宫内膜脱落不全。另外，还会导致子宫颈管阻塞，使月经排出受到阻碍，也可能导致月经不调。
2、子宫内膜炎
子宫内膜的生长和脱落受到内分泌激素的调节，当内分泌激素水平异常时，可能导致子宫内膜过度增生或不规则脱落，引起月经不规律和持续出血。
3、子宫内膜异位症
子宫内膜异位症是指子宫内膜异位生长在子宫外的一种疾病，其中异位组织随着月经周期的变化也会进行相应的生长和脱落，但由于异位组织在子宫外，无法顺利排出体外，导致疼痛、不孕以及月经异常等症状。其中，月经总是不干净是子宫内膜异位症常见的症状之一。
除此之外，还要警惕子宫肌瘤也会引起这种情况，建议及时就医，在医生的指导下进行规范治疗。
