一般情况下，16岁进行隐匿性阴茎手术不算迟。建议及时前往医院检查，在医生的指导下进行手术。分析如下：
16岁的男性在青春期发育阶段，大多数人的生殖器官已基本发育成熟。如果经过专业医生评估，确认生理条件适合手术，并且隐匿性阴茎对患者的生活造成了影响，如影响个人卫生、自信心或性功能，在家长同意和医生指导下，进行隐匿性阴茎手术不算迟。
每个患者的生长发育情况都是不同的，因此隐匿性阴茎的严重程度和手术时机也会有所不同。有些患者可能在年龄较小时就已经出现明显的症状并需要手术干预，而有些患者则可能随着年龄的增长而逐渐改善。
患者需要在术前做好充分的准备工作，并在术后积极配合医生的指导进行恢复。
