一般情况下，不存在益生菌什么时候服用效果最佳的说法。益生菌什么时候服用，主要取决于自身的消化情况。若消化状况良好，早餐前或饭后半小时服用效果最佳。若消化状况不佳，睡前服用效果最佳。具体分析如下：
如果自身消化道功能正常，无便秘、腹泻、腹痛等症状，可以选择每次早餐前或饭后半小时服用。早餐前服用，胃酸分泌较少，能够激活肠道功能，促进肠胃蠕动。饭后半小时服用，胃内酸碱度适宜，可减少胃酸对益生菌的破坏，有利于药效发挥。
但如果自身消化道功能较弱，有便秘、腹泻、腹痛、恶心等症状，则建议每天晚上睡前服用。因为夜间新陈代谢速度比较缓慢，肠道活动比较弱，服用益生菌后停留在肠道内的时间较长，有助于维持肠道菌群的平衡，改善肠道功能。
需注意，服用益生菌前应了解相关事项，若对其过敏，不建议服用。儿童及孕妇应在医生的指导下服用，避免擅自服用引起不适。
