一般情况下，婴儿痉挛症三岁后能否自愈，主要取决于疾病的原因以及病情的严重程度。若病情轻微，无其他的伴随症状，通常有自愈的可能。若病情严重，存在脑结构异常等症状，则可能无法自愈。如果症状持续时间较长，需就医处理。具体分析如下：
婴儿痉挛症如果只是由短暂的代谢紊乱、某些特定的环境等生理性因素所致。且目前婴儿的情况不严重，只是轻微的脑部损伤，无其他的伴随症状，三岁后，随着年龄增长，症状可逐渐得到缓解，并实现自愈。但需及时改善生活习惯，并远离致病因素，以减轻对大脑组织的损害程度。
但如果婴儿痉挛症是由新生儿窒息、病毒性脑炎、宫内感染等病理因素所致，而且自身存在脑结构异常、神经元功能障碍等，那么自愈的可能性通常较低。这些病因引起的婴儿痉挛症往往是无法逆转的，且病情比较严重，若不及时治疗，可能会引起更严重的后遗症，如脑瘫、智力低下等。因此，需及时根据病因长期治疗，并按时随访。
查出婴儿痉挛症后应及时根据病因及严重程度制定合适的治疗方案。同时，治疗过程中需密切关注婴儿的变化，以便及时进行相关的护理，以控制病情的进展。
