部分儿童手足口病会引起腹泻。 手足口病是肠道病毒感染引起的肠道病毒感染性疾病，肠道病毒感染引起的腹泻可能是手足口病引起的腹泻。 可以指示患儿吃流质食物、不太热的食物、容易消化的食物，多喝水、果汁等。 多吃富含纤维素的食物，提高机体免疫力和抵抗力。
手足口病可能会治愈。
患儿病情较轻，如体温一般不超过38.5℃，仅口、手、足、臀部有皮疹，但患儿精神状况好、饮食正常，此类患儿一般可达到自行治愈。病程一般为5~7天，且预后良好。但部分手足口病患儿症状较严重，病情发展迅速，容易诱发严重的并发症。
常见的并发症主要有肺水肿、脑膜炎、脑炎等。患儿可表现为反复高热、精神不振、食欲不振、嗜睡等，甚至严重者可发生昏迷现象。这种情况的患儿不能自行治愈，需要及时就诊。