腋窝挂号的科室要根据患者的具体情况进行评估和判断。出现皮肤问题时，比如腋窝皮肤湿疹、腋臭等，都可以到正规医院皮肤科就诊。如果是需要进行手术的腋臭，可以普通外科或者整形外科就诊。
腋下疼痛可以挂皮肤科、普外科、乳腺外科、骨科、急诊外科等。
如果腋下疼痛伴随有皮肤红肿、丘疹、脓包等症状，可能是毛囊炎、疖肿、带状疱疹等皮肤疾病引起的。此时，应前往皮肤科就诊。
如果腋下疼痛是由于外伤、淋巴结炎、淋巴结核等因素导致的，或者是在剧烈活动后出现的软组织损伤，可以挂普通外科。
如果腋下疼痛与乳腺相关，如乳腺增生、乳腺炎、乳腺癌等，应挂乳腺外科。
如果腋下疼痛伴有手臂活动受限、关节疼痛等症状，可能是由于骨骼问题引起的，如肩关节脱位、骨折等。此时，应前往骨科就诊。
如果腋下疼痛突然发作，且症状较为严重，或者伴有高热、寒战等全身症状，可能是急性乳腺炎、淋巴细胞白血病等严重疾病的症状。此时，要及时前往急诊科就诊。