阴囊到肛门之间疼痛可能是炎症刺激或者细菌感染所引起，也不排除是前列腺炎所导致，具体治疗方法要到医院做详细检查，根据检查结果对症治疗。如果是炎症刺激引起，可以在医生指导下口服消炎药物治疗，如头孢克洛缓释片、阿奇霉素、左氧氟沙星片，能够使疼痛得到改善。
阴囊肛门瘙痒抓挠后疼痛的原因包括以下几点：
1、过敏反应：这种情况可能与过敏反应有关，特别是当内裤质量不佳或使用刺激性洗剂时，容易引起皮肤红肿、瘙痒，过度抓挠则可能导致皮肤破损和疼痛。
2、局部刺激：过度清洁、使用刺激性的洗涤剂或香皂、穿着紧身衣物引起的局部刺激，也可能导致该区域的刺激和不适。
3、湿疹：湿疹是一种慢性炎症性皮肤病，可能由免疫、遗传、环境等多种因素引发，表现为皮肤干燥、红肿、起皮和瘙痒，抓挠后同样可能加剧症状。
4、采取措施：建议避免抓挠，保持局部清洁干燥，可以使用温和无香料的清洁剂清洗，并在干燥后涂抹抗真菌或抗病毒药膏。穿着宽松透气的棉质内裤，避免使用可能引起过敏的洗涤剂或柔顺剂。