磁共振检查肛瘘可能难受，难受可能会在正常人承受范围之内，确诊肛瘘后，可以在医生的指导下使用外用的药物来治疗，比如高锰酸钾溶液清洗等，如果全身出现感染，可以在医生的指导下，使用抗生素的药物来进行治疗，如果得不到缓解，可以通过手术切除或者切开 瘘管的方式进行治疗。
磁共振检查是一种非侵入性的医学成像技术，通过强大的磁场和无线电波来产生详细的身体内部图像。MRI能够检查多种身体结构和器官，包括但不限于脑部、脊髓、关节、肌肉、血管和内脏器官。
在脑部检查中，磁共振检查可以检测脑肿瘤、脑出血、脑损伤、脑血管病变以及多种神经性疾病。磁共振检查能够清晰地显示脊髓压迫、椎间盘突出、关节软骨损伤和关节炎症等。
此外，磁共振检查在评估心脏和血管结构、功能以及血流方面也发挥着重要作用。磁共振检查还能帮助医生检测肿瘤、炎症、出血、感染、退行性病变等多种病理变化，为疾病的早期发现、准确诊断和治疗计划制定提供重要依据。与X光和CT相比，磁共振检查不使用辐射，对患者更为安全。
但是，由于其依赖磁场，体内有金属植入物的患者可能无法进行磁共振检查。