胆管总管囊肿的原因多样，涉及先天性因素、胆管发育不良、胆道感染、胆道梗阻以及家族遗传等多个方面。先天性因素：在胚胎时期，如果胆总管发育不良，可能导致胆总管出现囊性扩张，从而形成囊肿。胆管发育不良：胚胎时期胆管发育不良可能引发胆管炎症反应，进而发展为胆总管囊肿。胆道感染：胆道受到细菌等致病菌的入侵后引发炎症反应，这也可能导致胆总管囊肿的形成。胆道梗阻：胆道梗阻会导致胆汁无法排出，进而引起胆汁淤积，这同样可能促使胆总管囊肿的发生。家族遗传：家族中有患胆总管囊肿的人群，其后代的发病率可能会增加。
孩子肝外胆管较细，胆囊壁粗糙时，胆道梗阻或先天性胆道狭窄可能是导致肝外胆管细的主要原因。
胆道是连接肝脏和肠道的管道，负责输送胆汁。当胆道出现梗阻或狭窄时，胆汁的流动受阻，可能导致肝外胆管变细。这种情况可能是先天性的，即孩子在出生时就已经存在。胆囊壁毛糙可能与胆源性疾病有关。
胆囊壁毛糙是胆囊炎的一种影像表现，可能由胆囊结石、急性胆囊炎、慢性胆囊炎等疾病引起。这些疾病会导致胆囊壁出现炎症、水肿、充血等病理变化，进而表现为胆囊壁毛糙。
胆囊结石和胆囊炎等疾病在儿童和青少年中虽然相对较少见，但仍有可能发生。