肾囊肿通常不会自己好。肾囊肿不属于自愈性疾病，一旦发现，通常会随着年龄增长，导致囊肿个数增多，也会逐渐变大，因此需要遵医嘱定期监测肾囊肿，观察病情变化。如果肾囊肿超过4厘米或者5厘米时，需要在专业医生的操作下通过超声介入穿刺手段治疗。如果囊肿超过10厘米，并且出现压迫症状时，需要在医生指导下采取外科手术治疗。
一般如果是生理性囊肿或小型炎症性囊肿可能会自行消失；而肿瘤性囊肿或大型、有症状的囊肿则通常不会自行消失。
女性在生理期时由于激素水平变化而形成的卵巢生理性囊肿，有可能会随着激素水平的调整和月经周期的变化而逐渐减小并最终消失。此外，由炎症引起的小型囊肿，当身体自身的免疫系统发挥作用，消除了炎症因素后，囊肿也可能会逐渐萎缩直至消失。人体具有一定的自我修复和调节能力，当囊肿周围的血管、淋巴管等组织正常工作时，可以带走囊肿内的液体成分，使囊肿变小直至消失。但这一过程通常比较缓慢，并非所有囊肿都会自动消失。
肿瘤性囊肿是由细胞异常增生所形成的，通常不会自行消失。肿瘤性囊肿的细胞具有持续增生的能力，这些囊肿可能会随着时间的推移而逐渐增大，甚至可能恶变为恶性肿瘤。此外，一些大型、有症状的囊肿，如肝囊肿、肾囊肿等，一旦形成，通常会持续存在并且可能随着时间的推移慢慢增大。这些囊肿可能会压迫周围组织器官，引起疼痛、功能障碍等症状，这种情况下往往需要医疗干预，如通过手术切除或者穿刺抽液等方法进行治疗。
发现囊肿后，应定期进行体检以观察囊肿的变化。如果囊肿增大或出现其他症状，应及时就医。保持良好的生活习惯，避免对囊肿区域施加额外的压力或刺激，保持良好的生活习惯和心态，有助于减少囊肿的发生和发展。