当发现甲流病毒，要排除乙流病毒时，采取的措施包括：1.执行病毒检测：对血清、血浆或细胞进行分离和鉴定，以确定甲流病毒。2. 血清学比较：通过查看病人血清中甲流病毒抗原与乙流病毒抗原的相互作用，以确定病毒类型。3. 免疫检测：免疫检测可以检测出抗甲流病毒的抗体，以及抗乙流病毒的抗体，从而确定两种病毒的情况。4. 集合分析：运用细胞免疫吸附分析（CIEP）、核酸酶链反应（PCR）等方法，分析病毒基因，进行病毒流行病学研究。5. 活体分离：活体分离实验可以用于检测病毒，以识别甲流病毒并确定其有效性。此外，还可以运用实验室分析、病毒荧光染色等技术，来检测甲流病毒，以确定是否排除乙流病毒的可能性。