甲流乙流检查结果通常在检测后的两小时内就能够出结果，但是也有一些情况需要更长时间，比如样本数量很多，仪器故障，实验条件复杂等。若采用PCR技术进行检测，一般20分钟可以测出结果，并通过荧光素检测仪检测病毒核酸，进而得出检测结果。但是，如果采用实时荧光定量PCR（real-time PCR）技术，结果很可能会比较慢。此时，检测结果需要等待1-2小时，或者更长的时间，直到检测荧光曲线，再判断出病毒核酸的位点和比例。由于甲流乙流的基因突变较多，当使用传统PCR技术时，检测结果将比较保守，检测时间也会较长。因此，对于甲流乙流检查，最佳检测结果一般需要大约2-4小时才能够出来。