甲流和乙流是两种不同的流感病毒，因此检测它们的手段也有所不同。为了诊断甲流，可以采用实时聚合酶链式反应（RT-PCR）或病毒培养。通过检测特异性核苷酸片段，RT-PCR可以有效地定性检测甲流病毒的存在。RT-PCR可以很快地得出结果，在几天内就可以获得结果。病毒培养是一种更耗时的检测方法，可以识别分离出甲流病毒，但需要几周才能获得准确的结果。诊断乙流病毒需要使用血清针检测（HI）或病毒培养法。HI检测可以确定患有流感的患者对乙型流感病毒的针对性反应，并可以在几天内获得结果。病毒培养法也可以确定乙型流感病毒的存在，但需要几周才能获得准确的结果。