甲流乙流检查流程主要通过根据患者体征和病史，检查患者血清或组织学标本，测定抗体水平，辅以病毒基因检测等多种诊断方法，来对甲流乙流进行诊断。具体流程如下：1.流行病学调查，询问患者有无典型的甲乙流症状和接触史；2.体格检查，检查患者的体征；3.实验室检查：血清学检测、细胞学检查、VDRL试验、病毒斑点抗体试验、NPCR和RT-PCR等；4.影像学检查：头颅CT，放射学特征可显示脑炎钙化；5.隔离鉴定和药物治疗：收集并病原学隔离标本，以多种抗生素进行治疗；6.免疫治疗：给患者接种局部或整体免疫治疗，改善患者的免疫功能。