四价流感疫苗和二价流感疫苗的主要区别在于，前者接种剂量加大，可抵抗流感病毒四种血清型。而二价流感疫苗只能预防流感病毒两种血清型。四价流感疫苗的接种有助于更好地抵御比较新的流感病毒类型，包括新出现的H1N1流感病毒。另外，四价流感疫苗中含有高分子量蛋白胶，能提高免疫力，有利于给儿童、老年人和免疫力较弱的患者提供更全面的保护。
然而，四价流感疫苗和二价流感疫苗相比，存在一定的不足和副作用。四价流感疫苗的接种有助于提高比较新的流感病毒抵抗力，但并不能抵御更老的流感病毒；而二价流感疫苗则反之。四价流感疫苗可能会引起疼痛、发热和肿胀等，并可能会出现过敏反应，需要医生或护士的监测和护理。