一般来说，甲流和普通感冒存在一定的区别。在发病季节就有所不同：甲型流感部分季节发生，主要在秋冬季节发生。而普通感冒主要是在气候温差较大的时候发生，主要是在秋末以及春天。另外两者的病原微生物存在差异，普通感冒可能是呼吸道合胞病毒或者鼻病毒感染，而甲流是甲型流感病毒感染，传染性较强。在严重程度上，甲流较普通感冒重，也更容易导致肺部炎症。如出现甲流或其他感冒症状，建议及时就医。
流感和普通感冒在多个方面存在显著差异。流感主要由甲型和乙型流感病毒感染引起，而普通感冒则多由鼻病毒、副流感病毒等多种病毒所致。在传染性上，流感具有更强的传染性，可通过飞沫、接触等多种途径迅速传播，而普通感冒的传染性相对较弱。
症状表现上，流感症状更为严重，常表现为高热、头痛、全身肌肉酸痛、乏力等全身中毒症状，且呼吸道症状相对较轻；而普通感冒则以鼻塞、打喷嚏、流鼻涕、咳嗽等局部症状为主，通常无发热或仅有轻度发热。
在治疗上也有所不同，流感患者特别是重症感染者需及时应用特异性抗病毒药物以减轻症状、缩短病程并降低并发症风险；而普通感冒则多以支持和对症治疗为主，多数患者可自行痊愈。
流感和普通感冒在病原、传染性、症状及治疗等方面均存在显著差异，需根据自身的情况进行治疗。