怀孕两个月肚子疼，有可能是异常妊娠，也有可能是其他疾病导致。1、异常妊娠。怀孕两个月肚子疼，有可能是先兆流产，宫外孕等异常妊娠导致，需要尽快去医院做B超检查。如果显示子宫腔内有积血，有可能是先兆流产，如果显示胚胎长在子宫以外的位置，说明是宫外孕。都需要尽快治疗。2、其他疾病。怀孕两个月肚子疼，也有可能是盆腔和腹腔的其他疾病引起的。比如肠炎导致的肠绞痛，盆腔炎引起的神经性疼痛，以及泌尿系结石导致输尿管痉挛而引起的肚子疼。如果出现身体不适或异常，持续时间较长，无法自行恢复，应该及时到医院就诊，避免耽误治疗。