孩子头疼肚子疼可能是上呼吸道感染、消化不良、急性肠胃炎引起的。1、由于上呼吸道感染会引起炎症反应，一些炎症因子进入颅内循环就会引起头疼的情况，病情严重时，也会导致患者出现肚子疼的情况。可以在医生指导下使用奥司他韦、利巴韦林等药物进行治疗。2、由于患者进食了大量生冷、刺激性食物，导致消化道功能不适，会出现头疼肚子疼的情况。可以在医生指导下使用健胃消食片、乳酸菌素片等药物进行治疗。3、急性肠胃炎是由于各种因素引起的肠胃炎性病变的一种疾病。主要包括腹部疼痛、腹泻等症状，严重时也会导致患者出现头疼。可以在医生的指导下使用氧氟沙星、头孢氨苄等药物进行治疗。