一般情况下，三个月宝宝拉肚子可能是腹部受凉、急性肠炎、胃肠道菌群失调等导致，应该对症治疗。1.如果腹部受凉，可能会导致肠蠕动速度加快，食物通过肠道时大量的水分未被充分吸收，出现拉肚子。可以在医生的指导下使用小儿腹泻贴、口服小儿腹泻宁糖浆、小儿腹泻散等药物。2.急性肠炎主要是由肠道发生急性感染导致，临床有腹泻，需要在医生的指导下进行抗感染治疗，配合蒙脱石散等综合治疗。3.胃肠道菌群失调通常指正常的胃肠道菌群在体内与外部环境的动态平衡被打破，临床表现为腹泻，多为不消化大便，在医生的指导下使用酪酸梭菌二联活菌散、乳酸菌素颗粒等药物来调理。建议及时就医。