如果肛瘘不及时治疗，可能会造成以下严重后果。1、排便困难：肛瘘导致肛门括约肌功能受损，患者在排便时会感到疼痛和不适，甚至会出现便秘。长期便秘会导致肛门和肛管周围的组织炎症加重，加重肛瘘的症状，形成恶性循环。2、感染和炎症：肛瘘通常是由肛门周围的感染引起的，如果不及时治疗，感染会不断蔓延，导致更严重的炎症，甚至会感染到周围的组织和器官，造成更严重的健康问题。3、肛门周围皮肤的损伤：由于肛瘘导致肛门周围的皮肤长期受到粪便和分泌物的刺激，容易发生皮肤炎症、瘙痒、溃疡等问题，严重影响患者的生活质量。因此，肛瘘严重时需要及时就医，接受医生的治疗。