二氧化硫是一种无色、有刺激性的气体，吸入后容易被湿润的黏膜表面吸收，生成亚硫酸或硫酸，对呼吸道产生腐蚀作用，引起明显的上呼吸道不适，严重的患者可能会出现喉头水肿、肺水肿等致命性疾病。二氧化硫还可能致癌，较高浓度的二氧化硫污染会导致肺癌、乳腺癌、大肠癌的发生率增高。同时，二氧化硫也是一种血管活性物质，易增加患有白血病、心肌病、心肌炎等心血管疾病的风险和死亡率。此外，长时间接触二氧化硫还可能影响孕妇和胎儿的健康，增加胎儿出现先天性畸形的几率。
一般情况下，二氧化氯基本没有危害，而对人体有危害的是氯气。主要可引起眼和呼吸道刺激。
如果长时间吸入高浓度，则可发生肺水肿，甚至导致死亡。同时，高浓度的气体，还可能对皮肤有刺激性。当皮肤接触或摄入高浓度溶液，可能引起强烈刺激和腐蚀，长期接触可导致慢性支气管炎。
此外，二氧化氯具有强氧化性，空气中的体积浓度超过10%便有爆炸性，但其水溶液却是十分安全的。在使用二氧化氯时需严格控制浓度，确保操作环境通风良好，并佩戴好个人防护装备