儿童自闭症的原因复杂多样，主要包括以下几点：1.遗传因素：自闭症具有高度的遗传性，遗传度高达80%~90%，通常与多个基因的突变有关，这些基因涉及大脑发育和神经传递途径。2.免疫系统异常：如辅助T细胞和B细胞数量减少、抑制-诱导体细胞缺乏、自然杀伤细胞活性减低等，均可能引起自闭症。3.脑结构和功能异常：自闭症患者的脑结构和功能可能存在异常，如丘脑等脑区的功能缺陷，或小脑、脑干缩小等。4.环境因素：母亲怀孕时的高龄、孕期感染病毒、使用某些药物，以及孕期护理不当如吸烟、酗酒等，都可能增加孩子患自闭症的风险。