宝宝脚指甲起层可能有多种原因：1.营养不良：宝宝如果挑食、偏食或饮食不均衡，可能导致体内缺乏维生素或微量元素，如维生素B12、叶酸、铁、锌等，进而引发指甲起层、脱皮等症状。2.真菌感染：甲癣（灰指甲）是一种常见的真菌感染，可能导致宝宝脚指甲增厚、分层。这可能与家庭中有人存在真菌感染或使用公共浴池有关。3.银屑病：如果宝宝家族中有患银屑病的人，其后代患病的概率较大。银屑病可能导致皮肤瘙痒、指甲起层等症状。针对这些可能的原因，建议家长注意宝宝的饮食营养，避免挑食、偏食，并加强卫生习惯，如勤洗脚、手，避免使用公共浴池等。如有需要，及时就医，遵医嘱治疗。