扁桃体发炎时，选择就诊科室主要取决于病情的严重性和医院的科室设置。一般来说，以下科室是与扁桃体发炎密切相关的：
1.耳鼻喉科：扁桃体位于喉部，因此首选耳鼻喉科就诊。耳鼻喉科医生能够通过专业检查手段，如喉镜，准确评估扁桃体炎症的程度，并给予相应的治疗建议。
2.呼吸内科：由于扁桃体发炎可能伴随呼吸道感染的症状，如咳嗽、流涕等，因此呼吸内科也是一个合适的就诊科室。呼吸内科医生能够综合考虑呼吸道整体状况，提供全面的治疗方案。
3.儿科：对于儿童患者，由于儿童的生理特点和免疫系统尚未发育完全，儿科医生在诊断和治疗儿童扁桃体发炎方面可能更具经验。
扁桃体发炎时应优先考虑耳鼻喉科就诊，同时也可根据病情选择呼吸内科或儿科。