呼吸困难在就医时，可以根据以下建议选择合适的科室：
1.呼吸内科：主要处理与呼吸系统相关的疾病，如肺部感染、哮喘、慢性阻塞性肺病等，这些症状常常伴随呼吸困难。
2.心内科：针对心脏疾病如心力衰竭、心律失常等引起的呼吸困难进行诊断和治疗。
3.急诊科：如果呼吸困难症状严重且突然发生，建议立即前往急诊科，以获取紧急的医疗评估和治疗。
4.耳鼻喉科：当呼吸困难与鼻腔或喉咙问题有关时，如喉炎、声带问题等，耳鼻喉科是合适的就诊科室。
具体科室的选择应根据医院的科室设置和医生的专业意见来确定。在就诊前，建议先咨询医疗机构的工作人员，以获得更准确的指导。