慢性细菌性前列腺炎与无菌性前列腺炎的主要区别如下：
1.病因不同：慢性细菌性前列腺炎主要由大肠埃希菌、变形杆菌等细菌引起；而无菌性前列腺炎则与支原体、衣原体感染及性生活不规律等因素相关。
2.检查结果不同：慢性细菌性前列腺炎的前列腺液培养会显示有细菌生长；而无菌性前列腺炎的前列腺液则无细菌生长。
3.临床表现不同：慢性细菌性前列腺炎常有尿频、尿急、尿痛等明显的尿路刺激症状；而无菌性前列腺炎主要表现为长期反复会阴部疼痛及前列腺压痛，尿路刺激症状相对不明显。
4.治疗不同：慢性细菌性前列腺炎的治疗以抗生素为主；而无菌性前列腺炎则主要采用多西环素、红霉素、甲硝唑等药物。