脚底脱皮、瘙痒并伴有小水泡的症状，可能由多种皮肤问题引起，如足癣、湿疹或汗疱疹等。针对这些症状，治疗时可以选择以下药物：
1.抗真菌药物：如果是由真菌感染引起的足癣，可以使用如复方酮康唑乳膏、盐酸特比萘芬乳膏等抗真菌药物，以清除脚部的真菌并改善病情。
2.抗组胺药物：对于由过敏或湿疹引起的症状，抗组胺药物如氯雷他定、西替利嗪等可以帮助改善瘙痒和其他不适。
3.糖皮质激素药物：如地塞米松、卤米松等糖皮质激素药物，可缓解瘙痒并改善脚部水泡的症状，但需注意不宜长期使用以避免副作用。
在使用这些药物时，建议遵循医生的指导，并注意保持良好的足部卫生习惯，如穿透气鞋袜、保持脚部干燥等，以促进病情的恢复。