产前基因检测一般不能直接查出自闭症。自闭症属于复杂的神经系统发育障碍，其发病原因涉及遗传因素、环境因素、脑结构发育异常等多方面。自闭症与遗传因素有密切关系，但它并不属于单基因遗传性疾病，而是由多个基因和环境因素共同作用的结果。产前基因检测主要针对的是明确的单基因遗传病，如21-三体综合征、18-三体综合征等，而自闭症的相关基因序列较多，且与环境因素密切相关，因此难以通过产前基因检测来准确预测。此外，自闭症在产前也没有较好的预防措施，孕妇在怀孕期间应注意避免不良因素，如烟酒刺激、随意服用药物等，以降低自闭症的发病率。