针对重度萎缩性胃炎伴重度肠化的治疗，应综合考虑多个方面：
1.药物治疗：根据病情，采用中药汤剂并加用抗癌、防癌药物，如白花蛇舌草等，同时避免过度使用质子泵抑制剂。
2.调整饮食：采用高营养、易消化的食物，如米粥、面条等，避免辛辣、刺激性食物，遵循少食多餐原则。
3.幽门螺杆菌治疗：如存在幽门螺杆菌感染，采用四联法进行治疗，包括抗生素、铋剂和质子泵抑制剂。
4.精神心理治疗：关注患者的心理状态，配合家庭治疗和鼓励疗法缓解情绪。
5.手术治疗：在必要时，通过近段胃部切除术或胃大部切除术等手术方式直接切除病灶。