慢性细菌性痢疾与阿米巴痢疾的区别主要体现在：
1.病原体：慢性细菌性痢疾主要由痢疾杆菌（属于志贺氏菌）引起，而阿米巴痢疾则由阿米巴原虫感染所致。
2.传播途径：慢性细菌性痢疾通过污染的手、食品、水源或生活接触传播；阿米巴痢疾则主要通过摄入被阿米巴囊泡污染的食物或水源传播。
3.病症表现：慢性细菌性痢疾表现为腹痛、腹泻、腹胀等，且可能反复发作；阿米巴痢疾则主要表现为腹痛、腹泻，大便呈暗红色或果酱样，且易合并肝脓肿等并发症。
4.治疗方法：慢性细菌性痢疾主要通过抗菌治疗、调整肠道功能等措施；阿米巴痢疾则采用抗阿米巴药物治疗、调整饮食等方法。