长期口腔溃疡的患者，在挂号就诊时可以考虑以下几个科室：
1.口腔科：口腔溃疡是口腔科常见的疾病之一，口腔科医生能够对口腔黏膜的病变进行专业的诊断和治疗。
2.口腔黏膜科：对于大型口腔专科医院，分科更细，口腔黏膜科是更专业的选择，医生在此领域有更丰富的经验和专业知识。
3.内科相关科室：若口腔溃疡与内科疾病（如胃肠功能紊乱、内分泌异常等）相关，则可以考虑前往消化内科、内分泌科等科室就诊。
若口腔溃疡与内科疾病相关，则应在口腔科医生的建议下，前往相应的内科科室进一步就诊。在就诊过程中，患者应详细描述病情，配合医生进行相关检查，以便确定病因并得到有效的治疗。