肝上囊肿的形成原因主要有以下几点：
1.先天性因素：胚胎时期肝内胆管或者淋巴管发育异常，形成囊状结构，这是肝囊肿最常见的原因之一。
2.肝脏损伤：肝脏受到损伤后，局部可能形成血肿、组织液化坏死，从而形成囊肿，这种情况多见于肝脏外伤后的假性囊肿。
3.寄生虫感染：如细粒棘球绦虫或多房棘球绦虫感染，虫卵进入肝脏后可能导致肝包虫病，进而形成囊肿。
4.炎症与结石：胆管炎症或结石梗阻可能导致肝内的胆管出现囊状扩张，形成胆汁潴留性囊肿。
5.肿瘤因素：肝内发生的囊腺瘤、畸胎瘤等肿瘤性病变也可能表现为囊肿。