生殖器疱疹作为一种性传播疾病，其就诊科室有多种选择，主要包括：
1.皮肤科：生殖器疱疹通常由单纯疱疹病毒感染引起，表现为生殖器部位出现疱疹，伴有瘙痒、疼痛等症状，属于皮肤黏膜病变，因此皮肤科是常见的就诊科室。
2.泌尿外科：如果生殖器疱疹引起泌尿系统的不适症状，如排尿疼痛、尿道烧灼感等，可以到泌尿外科就诊。
3.性病科：由于生殖器疱疹属于性传播疾病，患者也可以选择性病科进行专业的诊断和治疗。
4.男科或妇科：根据患者的性别，男性可以选择男科，女性可以选择妇科进行就诊，这些科室的医生能够针对生殖器疱疹提供更具体的诊疗建议。
生殖器疱疹患者可以根据自身症状和医院科室设置情况，选择合适的科室就诊。建议及时就医，遵医嘱进行治疗，以免延误病情。