要彻底根治扁平疣且不留痕，可以遵循以下策略：
1.选择适当的治疗方法：包括药物治疗、冷冻治疗、激光治疗等。其中，激光治疗因其精确度高、不易留疤而备受推崇，但价格较高，需根据个人情况选择。同时，避免采用可能留下明显痕迹的治疗方法，如不当的手术切除。
2.避免搔抓：扁平疣患者应避免搔抓患处，以防感染扩散或诱发瘢痕形成。
3.增强免疫力：扁平疣是由人乳头瘤病毒感染引起，增强机体免疫力有助于减少病毒感染和复发。可以通过适当锻炼、合理饮食、保证充足睡眠等方式提高免疫力。
4.注意个人卫生：避免与他人共用毛巾、脸盆等个人用品，减少交叉感染的风险。