扁平疣不是衣原体感染。扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染所引起的一种皮肤病，尤其是HPV病毒3型和HPV病毒5型为主要病原体。这种疾病主要通过直接接触或间接接触传播，如共用毛巾、浴巾等物品可能导致交叉感染。扁平疣多发生在青少年和儿童的面部、手背等暴露部位，表现为米粒至黄豆大小的扁平隆起丘疹，呈圆形或椭圆形，表面光滑，颜色多为淡褐色或正常肤色。与衣原体感染不同，扁平疣的治疗主要依赖于抗病毒药物、免疫调节剂以及物理治疗方法如激光、冷冻等。因此，扁平疣和衣原体感染在病原体、传播途径和治疗方法上存在显著差异。