传染性软疣与扁平疣的区别主要体现在以下几个方面：
1.病因：传染性软疣由传染性软疣病毒（MCV）感染引起，而扁平疣则是由人乳头瘤病毒（HPV）感染所致。
2.症状与表现：传染性软疣的典型症状为皮肤上出现蜡样光泽的半球状丘疹，中央呈脐窝状，可挤出乳酪状软疣小体，好发于儿童和青年人，可发生于身体任何部位，但以躯干和四肢为主。扁平疣则表现为坚硬的、扁平的丘疹，表面粗糙，呈单个或多个分布，主要发生在面部、手背和前臂等暴露部位。
3.传播途径：传染性软疣主要通过直接接触或性接触传播，而扁平疣则主要通过皮肤破损或抓痕传播。
4.病程与治疗：传染性软疣的病程相对较长，通常需要数周至数个月的时间才能痊愈，治疗方法包括刮除疣体并使用抗病毒药物。扁平疣的病程相对较短，通常在几个月内自行消退，治疗方法包括药物、激光或冷冻等。