扁平疣和寻常疣的区别主要体现在：
1.感染病毒类型：扁平疣主要由HPV-3型等病毒感染引起，而寻常疣则多由HPV-2、4、7型等病毒感染所致。
2.皮损形态：扁平疣呈现为平坦、圆形或椭圆形的小凸起，表面光滑或微粗糙；寻常疣则表现为坚实的丘疹，表面粗糙，角化明显，多呈圆形或多角形。
3.好发部位：扁平疣好发于面部、手背及前臂等部位；寻常疣则好发于手指、手背、足缘及面部、前臂等处。
4.发病年龄：扁平疣多见于青少年，尤其是青年女性；而寻常疣的发病年龄则相对广泛，男女均可患病。
5.传染性：扁平疣的传染性相对较弱，通常不会传染给他人；而寻常疣则可能感染患者身体的其他部位，但同样不会轻易传染给其他人。