扁平疣的去除方法主要包括：
1.药物治疗：患者可以在医生指导下，局部使用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等外用药物，这些药物能够抑制皮损的生长，促进表面剥脱，使皮损脱落。此外，对于症状反复的患者，还可以考虑使用干扰素α1b注射液、胸腺肽注射液等免疫抑制剂，以提高机体免疫力，避免疾病复发。
2.物理治疗：液氮冷冻、激光治疗等物理治疗方法也是常用的手段。液氮冷冻通过低温使疣体组织坏死脱落，而激光治疗则利用激光的光热效应破坏疣体组织，达到去除扁平疣的目的。这些治疗方法通常效果较快，但可能需要多次治疗才能完全清除。
3.手术治疗：如果扁平疣的数量较多或物理、药物治疗效果不佳，可以考虑手术切除治疗。但需要注意的是，手术治疗可能会留下疤痕，且费用相对较高。