治疗扁平疣的方法主要包括：
1.药物治疗：外用药物如维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等，可以抑制皮损的生长，促进表面剥脱。系统药物如干扰素α1b注射液、胸腺肽注射液等，用于提高机体免疫力，减少复发。请注意，药物治疗需根据皮损的不同情况选择药物及使用方法，并在医生指导下进行。
2.物理治疗：包括液氮冷冻、激光治疗、电灼术和刮除术等。这些方法通过物理手段直接破坏疣体，达到治疗目的。物理治疗适用于扁平疣数目较少者，术后应注意避免感染。
3.手术治疗：对于皮损较大或物理、药物治疗效果不佳的扁平疣，可采用手术切除治疗。此外，自体疣免疫疗法也是一种手术治疗方法，通过手术方式将自体疣植入皮下脂肪层，刺激机体产生抗病毒抗体，降低复发率。
4.中医治疗：中医中药疗法如耳后放血法、火针法、穴位注射法等，也在一定程度上用于治疗扁平疣。但请注意，中医治疗需在正规医疗机构中，由中医科医生指导进行。