一般情况下，肠镜检查是否痛苦，需要根据具体情况进行判断。若有不适，建议及时就医，具体分析如下：
1、不痛苦
肠镜检查是经肛门将肠镜循腔插入至回盲部，从黏膜侧观察结肠病变的检查方法，几乎可以满足全部结肠区域的检查需要。如果患者在肠镜检查前进行了充分的肠道清洁准备，使得肠道内部干净，没有残留物阻挡视野，这将大大降低检查过程中的不适感。而且许多医院在进行肠镜检查时会提供轻度镇静剂或麻醉，以减轻患者的紧张和不适。在镇静状态下，患者往往不会感受到明显的疼痛，甚至可能在检查过程中入睡，醒来时检查已经完成。加之经验丰富的医生能够更轻柔、迅速地完成肠镜操作，减少对肠道的刺激，从而减轻患者的不适感。这时肠镜检查可能是不痛苦的。
2、痛苦
然而，如果肠道未被充分清洁，残留的粪便或食物残渣可能会阻碍肠镜的推进，增加检查难度，同时也会使患者感到更多的不适。同时，若患者选择不使用镇静剂或麻醉，肠镜插入和移动时也可能会引起一定程度的腹痛或胀气感，尤其是对于肠道较为敏感的人群。此外，不同人的疼痛阈值和心理承受能力不同，一些人可能即使在良好条件下仍会感到检查过程中的不适或疼痛。这时肠镜检查可能是痛苦的。
为了尽量减少肠镜检查带来的不适，建议患者在检查前详细咨询医生，了解肠道准备的具体要求，并根据自身情况考虑是否需要镇静或麻醉。此外，与医生充分沟通自己的担忧和需求，也有助于提高检查的舒适度。检查前，注意调整饮食，保持肠道清洁。检查后，保持充分的休息，有利于身体健康。
