一般情况下，指甲根部凹陷可能是年龄增长、季节性变化、外伤、缺铁性贫血、甲状腺功能减退等因素引起的。建议及时就医，明确病因后，在专业医生的指导下进行对症治疗。具体分析如下：
1、年龄增长
年龄增长导致指甲床的血液循环变差，影响到指甲板的健康，使新长出的指甲可能出现凹陷。平时应保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动等，可以帮助维持指甲健康。
2、季节性变化
寒冷和干燥的环境会使指甲失去水分，变得干燥和脆弱，容易出现裂纹或凹陷。建议定期涂抹保湿霜，保持指甲周围的皮肤湿润。
3、外伤
指甲受到外力挤压或撞击等外伤，可能导致指甲根部受损，使指甲的正常生长和形态受到影响，从而引起指甲根部凹陷现象，注意保护好指甲，避免受到重物撞击或其他外伤，以免加重症状。
4、缺铁性贫血
缺铁性贫血可能是铁摄入不足、遗传等因素引起的，缺铁性贫血导致体内血红蛋白减少，进而影响了指甲的营养供应，使指甲的正常生长和形态发生变化，从而引起上述症状，可能伴有面色苍白、乏力、头晕等症状。可遵医嘱使用硫酸亚铁缓释片、枸橼酸铁铵泡腾颗粒、富马酸亚铁片等药物进行治疗。
5、甲状腺功能减退
甲状腺功能减退可能是自身免疫性疾病、药物等因素引起的，甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，导致指甲生长缓慢，形态异常，从而引起指甲根部凹陷现象，患者可能伴有畏寒、乏力等症状。可在医生指导下使用左甲状腺素钠片、甲泼尼龙片、醋酸泼尼松片等药物进行治疗，以缓解症状。
平时避免长时间浸泡，以免导致指甲干燥和脱屑，引发凹陷问题。同时定期修剪指甲，避免指甲过长或过短。
