一般情况下，停经45天B超看不到孕囊的原因可能是怀孕时间短、月经失调、黄体功能不全、流产、异位妊娠等。建议及时就医，明确病因后，在专业医生的指导下进行对症治疗。具体分析如下：
1、怀孕时间短
部分女性月经周期较长或排卵时间后移，导致实际受孕时间较短，孕囊尚未发育到B超可检测的大小。建议等待一段时间后再次进行B超检查，以确认孕囊发育情况。
2、月经失调
熬夜、暴饮暴食等原因会引起月经失调。虽然停经45天，但可能并未真正怀孕，而是由于月经失调导致的暂时停经。通常会伴随月经周期不规律、经量异常、痛经等症状。患者可在医生的指导下使用加味益母草膏、加味逍遥丸、乌鸡白凤丸等药物进行治疗。
3、黄体功能不全
黄体功能不全可能是遗传、黄体分泌孕激素不足等原因引起的，可能导致受精卵着床失败，即使着床也可能因黄体酮水平不足而无法维持妊娠，B超检查可能看不到孕囊。可能会出现月经周期改变、体温变化等症状。患者可遵医嘱使用黄体酮胶囊、黄体酮注射液、枸橼酸氯米芬胶囊等药物进行治疗。
4、流产
流产可能由染色体异常、子宫问题、免疫因素等多种原因引起，导致胚胎不能正常发育。所以在停经45天之后，B超还是看不到孕囊。还可能伴有阴道出血、腹痛等症状。需要听从医生建议使用米非司酮片、米索前列醇片、新生化片等药物帮助子宫清除残留组织。
5、异位妊娠
受精卵着床在子宫以外的部位，如输卵管等，会导致异位妊娠，导致B超在子宫内无法探测到孕囊。还会出现腹痛、阴道流血、停经后不规则出血等症状。需要在医生的指导下进行引产手术，是通过在腹部打孔，找到并清除着床在子宫腔外的胚胎组织，以达到治疗异位妊娠的目的。
平时需注意保持规律作息，均衡饮食，避免过度劳累与情绪波动，定期进行健康检查，以维护良好的生殖健康状态。
