一般情况下，孙女和爷爷可以做亲子鉴定，这种鉴定属于隔代亲缘鉴定。具体分析如下：
虽然爷爷与孙女之间没有直接的染色体遗传关系，但可以通过线粒体DNA检测以及常染色体检测等方法来判断两者之间是否存在亲缘关系。例如，孙女的线粒体DNA虽然来自母亲，但通过对常染色体上特定基因位点的检测和分析，能够在一定程度上判断爷爷和孙女的亲缘关系。
但这种隔代亲子鉴定的准确性相较于父母与子女之间的亲子鉴定会稍低一些，因为基因在传递过程中会发生重组和变异等情况，可能对结果的准确性产生一定影响。在进行鉴定时，需要选择正规的鉴定机构，按照要求采集血液、口腔拭子等样本。
