肛瘘就是因直肠肛管周围脓肿切开引流时，脓腔引流不畅，不易愈合，时间长了后，形成疤痕组织，进一步妨碍愈合，结果形成瘘道，即肛瘘。肛瘘手术恢复时间差异较大，与患者具体病情，如瘘管大小、病情复杂程度、手术方式等密切相关。一般单纯低位肛瘘，手术切口较小、创伤小，恢复较快，约一周左右即可出院，出院后恢复时间大约2周。高位肛瘘一次性根治手术住院时间较长，一般需2周左右，出院后恢复时间约4-6周。复杂性肛瘘一般有多个外口、位置较高或合并结核病、克罗恩病等其他疾病，病情复杂，治疗周期较长，恢复期约几个月甚至更长时间。
进行肛瘘手术后，可以适当吃西红柿，芹菜、胡萝卜、鸡蛋、牛奶等食物，有助于身体的恢复。上述食物可以帮助人体补充一定的膳食纤维、蛋白质以及维生素等营养成分，及时获取人体在手术后身体进行正常生理活动所需的营养，避免出现营养不良。如果进行肛瘘手术后出现手术部位感染，需要遵医嘱使用罗红霉素胶囊等药物治疗。